Atualmente, o FBSSAN conta com o apoio institucional da Oxfam Internacional e da Campanha Cresça. Também realiza ações por meio de projetos pontuais apoiados por agências de cooperação e por entidades filantrópicas. Além disso, conta com apoio logístico e de pessoal das instituições de pesquisa, organizações e movimentos sociais que o compõem.